Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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