Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Xntrpc-202ENSMUST00000094129 4150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AC142266.1-202ENSMUST00000227784 3733 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Spdl1-201ENSMUST00000093191 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Camk2a-201ENSMUST00000025519 3244 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ubxn8-201ENSMUST00000095349 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms