Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms