Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms