Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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