Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms