Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tmf1B9EKI3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms