Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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