Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms