Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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