Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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