Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pramef6A2A8M8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pramef6A2A8M8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms