Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms