Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms