Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms