Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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