Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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