Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms