Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms