Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms