Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms