Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms