Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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