Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms