Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms