Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trappc6bQ9D289 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trappc6bQ9D289 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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