Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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