Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih4Q9CX13 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms