Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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