Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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