Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 AC160550.2-202ENSMUST00000227812 1861 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Cdk16-202ENSMUST00000115364 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sec61bQ9CQS8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms