Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms