Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms