Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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