Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms