Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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