Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprtQ99M80 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms