Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms