Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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