Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms