Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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