Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Stx18Q8VDS8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Stx18Q8VDS8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Stx18Q8VDS8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms