Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

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Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hecw1Q8K4P8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms