Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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