Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp27Q8CEG8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms