Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Atg4aQ8C9S8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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