Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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