Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtpaQ8BWP5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms