Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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