Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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